Ян Янович Фогель родился 24 ноября 1898-го в селе Дурэ Вольмарского уезда Лифляндской губернии. Участник Первой мировой и Гражданской войн.
Начало Великой Отечественной встретил в запасе РККА. Летом 1943-го возглавил созданный стрелковый корпус. Участвовал в Брянской наступательной операции. С 11 ноября 1943-го — командир 120-й гвардейской стрелковой дивизии. Руководил боевыми действиями в Гомельско-Речицкой и Рогачевско-Жлобинской наступательных операциях. За отличие при освобождении Рогачева дивизии присвоили почетное наименование «рогачевская».
Воины Фогеля отличились в Белорусской стратегической наступательной операции. Он умело организовал прорыв укрепленной обороны противника на реке Друть, способствовал окружению противника под Бобруйском.
8 июля 1944-го в бою за Новогрудок смертельно ранен. Похоронен в городе Дятлово Гродненской области.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 10 апреля 1945 года за умелое командование, образцовое выполнение боевых заданий на фронте в борьбе с немецко-фашистскими захватчиками и проявленные при этом мужество и героизм гвардии генерал-майору Яну Фогелю посмертно присвоено звание Героя Советского Союза.